人物专访 陈南:实验室的大师兄,产业界的先行者

发布日期:2021-08-04 浏览次数:6830



陈南博士,出生于河南省信阳市,2013年毕业于郑州大学化学与分子工程学院化学专业,获得学士学位;2019年毕业于北京大学化学与分子工程学院化学生物学专业,获得博士学位,师从王初教授,博士期间主要研究方向是化学蛋白质组学。2019年初前往美国洛克菲勒大学Tarun M. Kapoor教授课题组从事博士后研究工作,主要研究方向是化学蛋白质组学,同时也开展包括蛋白质共价抑制剂的设计和蛋白质结构生物学方面的研究。2021年初陈南博士回国后投入到实业中,共同创建了南京科络思生物科技有限公司,目前担任总经理的职位。


1. 关于研究课题

老羊皮:陈南师兄作为王初老师的第一个学生,也是带我进入化学生物学的领路人。18年的时候我曾参与过陈南师兄磷酸泛酰巯基乙胺化课题的研究,陈南师兄严谨的实验设计、细致的数据分析让我受益匪浅。时隔两年再一次见到南哥,就让南哥先介绍一下自己这一路来的科研经历,以及是什么原因让南哥在化学的众多分支中选择了化学生物学。


陈南:我本科进入郑州大学化学与分子工程学院学习,专业是化学,在校期间,有幸在李纲老师课题组参与了两年多的科研工作,和实验室的研究生师兄师姐一起做实验,当时非常喜欢科研探索,创造新物质的感觉。之后,通过了北京大学化学与分子工程学院暑期夏令营的考核,能够有机会在李笑宇老师(现任职于香港大学)进行毕业论文工作,第一次接触到了化学生物学。其实,当时对这个新颖的学科并没有太多的理解,只是觉得是一个很有前景的交叉学科,学到了很多课本里没有出现过的知识。


2013年正式入学北大之后,进入了化学生物学系王初老师课题组学习,主要研究方向是化学蛋白质组学。当时国内其实还没有课题组开展类似的研究方向,王初老师是最早将这一研究领域带入国内的,为此,自己也是感到很荣幸,能够接触到国际非常前沿的技术。现在,不管是国外国内,化学蛋白质组学技术的发展和应用都是有目共睹的。我的博士研究工作主要是利用化学蛋白质组学技术大规模分析细胞内两类重要的翻译后修饰。一个是,蛋白质N-同型半胱氨酰化修饰,与临床高同型半胱氨酸血症密切相关;另一个是磷酸泛酰巯基乙胺化,简称 “泛酸化”修饰,是一类细胞代谢必需的翻译后修饰。针对这两个修饰,我分别发展了相应的化学标记和代谢标记分子探针,同时结合定量蛋白质组学技术首次在哺乳动物细胞中对这两类修饰进行了修饰底物和位点的系统鉴定。除此之外,我还负责了一些合作课题和横向项目,利用化学蛋白质组学技术进行药物靶点鉴定。


博士毕业后,我去了美国洛克菲勒大学,从事博士后研究工作,主要方向还是化学蛋白质组学,同时也开展了一些新的研究方向,包括蛋白质共价抑制剂的设计和蛋白质结构生物学研究。今年3月底,我刚刚从美国纽约回来,和合伙人一起创建了现在的公司,南京科络思生物科技有限公司,未来将投入全部的精力和时间,努力将这个公司做好。


2. 作为大师兄是什么样的体验

老羊皮:我们都知道,南哥是王初老师的第一个博士生,参与了王初老师实验室创建的全过程。当年给我印象最深刻的就是购买试剂的时候,提陈南师兄的名字可以额外的打折,这也侧面证明了南哥在王初老师组的“地位”。那么请问南哥,这种参与建组的经历对你来说有什么感受吗?


陈南:整体感觉用一个词概括就是——有得有失。我先谈“得“的方面,有三点吧:一是,我能够参与到实验室从0到1的变化中。我其实是早于王初老师进入我们实验室的,当时王初老师实验室分配好之后,其实人还是美国,我是第一个进入实验室的。从最开始一张桌子,一台电脑,到自己毕业时,实验室十几个师弟师妹,实验台满是自己用过的,熟悉的仪器,这种跟随实验室一起成长的感觉是独一无二的;二是在实验方面得到了王初老师的亲自指导。不管是从科研思维的培养,还是课题思考、实验设计、结果分析,我都得到了实验室最权威的指导,对自己的博士生涯影响深远;三是,自己没有可以依靠的师兄师姐,除了导师的指导外,更多时候需要自己去思考、尝试。比如第一次实验没有经验忘记加对照组,下一次可能就会时刻提醒自己,不会犯第二、第三次错误。这个独立的过程,对于个人能力提升很有帮助,能够让我迅速的成长起来,承担起自己的课题。


当然,作为实验室的第一届学生,最开始的时候需要投入时间帮助王老师一起建立实验室,从仪器购买、调试、实验步骤优化等,都需要一点点积累,相比于其它实验室的同届同学,就不可避免的少了做自己课题的时间。由于实验室没有前期的积累,在课题领域方面也需要自己探索,这也需要花费比其他人更多的时间。还有就是,所谓大师兄,一般在新来的师弟师妹眼中,都是实验室全能的人物设定,无形中给自己很大的压力,这就要求自己付出更多,不断提升自己的能力,才能真正给师弟师妹们起到带头表率的作用。

当然,如果再给我一次选择的机会,我还是觉得能成为实验室第一个学生是一件非常荣幸的事情,不管是对于博士生涯,还是整个人生。


3. 科研中印象最深的事

老羊皮:前面南哥提到,作为实验室的大师兄其实是缺少可以依靠的师兄师姐的指导的,想必在五年的博士生涯中也会经历不少坎坷。科研过程中既有探索新事物的兴奋,也有得不到理想结果的失落,想必南哥也是这样一步一步走过来的。在这五年的科研经历中,请问南哥对哪些事印象深刻,背后的原因又是什么呢?


陈南:其实,整个博士生涯本身就是一段刻骨铭心的记忆,不管是知识、阅历,还是为人处世,都获益匪浅。和大多数博士一样,我的大部分时间也是在实验室中度过的,这个过程中给我印象最深的一件事是关于一个新课题的展开。


其实,我的博士科研过程并不顺利,前四年基本都处于课题摸索阶段,换了很多课题,尝试了很多方法,但结果和预想的差距很大,当然自己还是压力很大的。后来有一次在和王老师讨论新课题的时候,想做CoA的结合蛋白。因为CoA本身是细胞必需的辅酶因子,和许多重要的蛋白质相互作用,但对于它的全细胞结合谱图分析并没有人做过。最开始,简单的文献检索后觉得很兴奋,感觉这是一个比较值得做的方向,而且也是化学蛋白质组学技术所擅长的地方。但随着实验的深入和文献的全面分析,发现CoA可以形成很多衍生物,这些衍生物都有自己的结合蛋白,按照当时的实验设计,并不能区分它们,因此最后的实验结果可能并不能清楚地回答预先提出的问题。和王老师进行多次讨论后,觉得可能有必要在方法上进行优化,但这个时间就要很长,我当时已经接近第五年了,所以时间方面还是很紧张的,也想着是否直接放弃这个课题。但毕竟已经花费了很多的时间和经历在这个课题上,肯定不甘心,因此就接着阅读文献,想着能否换个方向,将前期工作积累利用上。


我一直对蛋白质翻译后修饰很感兴趣,所以重点就放在了CoA相关的翻译后修饰上,后来慢慢注意到了上面我提到的泛酸化修饰。和王老师讨论后,他觉得我应该将这个修饰的生物学功能和之前的研究方法一一了解清楚,然后决定是否继续这个课题。又经过了几番调研讨论之后,觉得泛酸化修饰的化学蛋白质组学分析确实很有必要,能够解决传统手段解决不了的问题,后来就一步步做了下去,相关的工作也已经发表了,整体看来还是一个比较满意的故事。


这个事情之所以给我印象深刻,我觉得两个方面:一是和导师的合作方式。因为王老师一直注重培养我们独立思考、设计完成课题的能力,尤其是第一届学生,很多时候只能依靠自己,这个时候就需要自己全身心地思考解决方法,然后找经验丰富的导师讨论,获得指导。整个流程下来,事半功倍,极大地提高了解决问题的效率。这件事告诉了我,对自己的事情,永远不要想着从别人那里得到解决方案,别人能够做的可以是锦上添花。带着可能的解决方案去寻求帮助会极大地提高成功的概率,这也是我之后做事情时一直提醒自己的。另外一方面是解决问题的思路。所谓上帝为你关上一扇门,肯定会为你打开一扇窗,自己需要做的就是肯去努力发现这扇窗在哪。其实,很多时候这个道理大家都明白,但就是缺乏足够的耐心,这里我也相当于以自身经历给实验室的师弟师妹们传授点经验,毕竟科研肯定不是一帆风顺的。


4. 从学术界到产业界 成立公司的契机

老羊皮:聊完了南哥过去的科研经历,我们再来聊聊南哥的当下。南哥年初回国之后并没有像我们想象的那样进入高校,而是选择创建了南京科络思生物科技有限公司,并担任了总经理的职位。想知道南哥选择了这个方向背后的原因和故事。


陈南:准确地说我现在还是没有完全脱离学术界,因为我们公司的一部分客户群体依然是高校、医院、医药研发企业的研究实验室,还是要和老师学生打交道,搞的还是基础研究。科络思生物是由南京大学郭子建院士发起并号召大家在一起做的,顾问团队包括北京大学和南京大学化学生物学领域顶尖研究团队。去年年底的时候,各位顾问老师在一起讨论,觉得目前不管学术界还是产业界,对质谱的需求越来越多。另一方面国内尽管有一些发展不错的蛋白质组学公司,但相比于国外,整体还处于初期阶段——尤其是化学蛋白质组学的市场,国内几乎没有公司涉足。美国在几年前就已经有了以化学蛋白质组学为核心技术的公司,而且市场发展很可观。同时,国家政策方面也鼓励高校老师进行成果转化,能够以技术服务于社会。在这个背景下,顾问老师们便有了创办一个化学蛋白质组学公司的想法,正好当时我想回国工作,自己本身一直从事相关的研究,一拍即合。我们依托于江苏南创化学与生命健康研究院有限公司,同合伙人一道在顾问老师的支持下成立了南京科络思生物科技有限公司。


5. 公司的主要业务和发展方向

老羊皮:公司创建的故事的确是精彩纷呈!的确,“十四五”规划也指出要推进产学研深度融合,南哥团队的工作也是为国家战略进了自己的一份力。自然地,我们也非常好奇科络思具体是一家什么样的公司,经营什么样的业务,未来在竞争激烈但又充满机会的市场中又将选择什么样的发展方向?


陈南:我们给自己的定位是国内首个立足于化学生物学交叉领域的高科技企业。公司将以前沿化学蛋白质组学技术为核心,主要业务包括蛋白质化学标记技术服务。我们拥有自己开发的抗体标记技术,能够实现非改造抗体的固定化学计量比、定点高效标记,例如荧光分子和稀土金属配合物标记。另外一个技术服务项目是化学蛋白质组学技术服务,这方面高校老师非常感兴趣,我们目前已经在和一些实验室合作,提供相关的技术服务,解决药物或者代谢物靶点鉴定问题,我们也希望能够产出一些不错的结果。当然,我们也需要更多的客户的支持,利用蛋白质组学能解决的问题,我们都会尽全力替大家解决。同时,我们也做蛋白质化学标记相关化学探针、生物正交反应等试剂研发与生产,这些不仅能够满足市场的需求、解决目前高度依赖进口的困境,同时也为公司技术服务和研发奠定基础。


除了上述这些业务呢,我们也为药企提供药物先导化合物筛选服务。我们知道,基于分子片段的配体发现策略,也就是我们熟知的fragment-based ligand discovery(FBLD),已经被广泛应用于药物先导化合物的鉴定中。但该方法通常局限于单一蛋白质体系,因此极大的限制了其通量,也不能很好地模拟自然状态下蛋白质与配体之间的相互作用。我们的化学蛋白质组学技术就可以有效地解决这个问题,它能够在复杂生物体系(细胞裂解液或者活细胞)中直接进行先导化合物筛选,实现多靶点同时分析,也就是说,革命性地将FBLD带入了高通量时代。事实上,美国的几家化学蛋白质组学公司已经和知名药物研发企业展开了类似的合作,利用基于质谱的化学蛋白质组学技术在活细胞体系上发掘共价药物先导化合物,希望替尽可能多的功能蛋白质找到潜在的配体结合口袋,靶向“不可成药”蛋白质


老羊皮:的确是激动人心的工作!化学蛋白质组学相比于传统蛋白质组学,引入了外源性化学小分子,从而能更加精准高效地实现对蛋白质组的分析,在药物筛选等领域有着令人激动的应用前景。那么对于有志于从事该领域的同学该如何了解和加入南哥的团队呢?


陈南:科络思生物希望以兼容并包的胸怀广聚天下英才,立志以推动化学,生物和医学研究交叉融合为己任,秉持“人才第一,技术优先,客户至上”的理念,力争成为世界知名的创新型服务与研发企业,做化学交叉前沿技术开发和应用的引领者。我们公司目前已经进驻了南京市栖霞区生命科技创新园,有足够的办公和实验空间。同时我们也获得了资本的支持,万事俱备,只欠东风,目前正在招兵买马阶段,希望志同道合的朋友可以加入我们,不管是本科生、硕士生还是博士生;不管是刚毕业的、有工作经验的志同道合者,都可以直接联系我,一起将这个公司做起来。我们目前希望招聘抗体标记、化学蛋白质组学技术服务、蛋白质组学研究与生信分析等相关领域的人。我的联系方式是13120177986,可直接加我微信。


6. 学校到公司的转变,风险与机遇的并存

老羊皮:作为在象牙塔中学习和生活的我来说,与社会接触更为紧密的公司略显陌生。在高校中也许专心做好科研就足够了,但对创建经营一家公司而言可能需要在更复杂的关系网中投入更多的精力。想请问南哥是如何成功地转变成总经理,这其中又有什么挑战呢?


陈南:在学校里大部分时间是从事科研实验,平时打交道的只有导师和同学,工作内容和人际关系都相对简单。但当自己创建公司时,需要和形形色色的人沟通交流,包括员工、投资人、合作伙伴和政府等。向不同的人传递合适的信息,还是很具有挑战性的。除此之外,目前对我而言,最大的挑战是如何让公司良好的运转起来。因为我刚刚从实验室出来,之前也没有相关的工作经验,所以很多东西都要从头学起,包括如何做一个好的商业计划书,如何和投资人讲清楚未来公司的定位、业务和发展目标,如何将公司框架一点点搭建起来,如何设计公司的管理体制和员工的薪酬体系等等。幸运的是,我们有一个非常强大的顾问团队,不管在客户资源、人才团队,还是在各种政策申请方面都给予了很多的帮助。我们也获得了依托企业南创研究院在公司注册、人员招聘等方面的大力支持,同时我们的投资方不仅仅提供了资金方面的慷慨支持,更重要的是在公司初期的建设、管理、财务等方面也给予了全方位的帮助,因此我们公司才能够在很短的时间内正常运行起来,开始和一些客户展开合作。当然,有挑战,才会有奋斗的激情,我也相信有身后强大平台的支持,我们创始团队和员工能够把这个公司越做越好。


老羊皮:从陈师兄到陈总经理,南哥身份发生了很大的转变。那么现在栖身于生物医药这个发展如火如荼的领域,南哥有什么自己的见解可以分享给我们呢?在当前的生物科技迅猛发展的今天,生物医学公司又将如何调整定位来面对这“百年未有之大变局”?


陈南:确实如此,这两年国内的生物医药市场发展势头很猛,这与大环境也是密不可分的。我毕竟也刚刚进入这个市场中,因此很多看法也并不成熟,我就目前的认知简单的谈一下自己的看法吧。一般来说,不管从事哪个领域,都是机遇和风险并存。机遇方面,因为市场在变大,资金、人、企业都在快速地流入这个领域。对于我们初创公司来说,都是利好的,只要自己的技术和产品过硬,就不存在人和钱的问题,当然客户规模也在逐渐扩大,形成了一个良好的循环。然而,竞争也就变得更加激烈。所谓商场如战场,初创公司需要迅速提升自己的实力,才能抵挡住快速袭来的竞争,不管是良性的还是恶性的,否则就会被相同赛道的大企业干掉。


老羊皮:非常深刻的理解!今天非常荣幸地与南哥在这里分享他这一路走来,有苦有甜的经历和故事,也衷心希望南哥的事业能够蒸蒸日上!最后再免费为大师兄打个广告,对科络思生物感兴趣的都欢迎直接与南哥联系(13120177986)!

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