背景介绍：

在药物研发领域，科学家们一直致力于针对特定疾病的创新疗法探索。为深入理解疾病分子机制并识别有效的治疗靶点，为新型药物的发现与开发提供关键线索和科学依据，差异蛋白分析技术已成为关键工具。它助力科研人员系统地检测蛋白质表达变化，发现与疾病相关的靶蛋白，指导新药开发和个性化治疗策略的设计。

随着高通量测序技术和质谱技术等前沿科技的发展与应用，差异蛋白分析的精确度和覆盖范围得以显著提升，使得科研人员能够在大规模数据基础上，对疾病进程中潜在药物靶点进行深度挖掘和细致评估。因此，在现代生物医药研究中，差异蛋白分析不仅是解析疾病复杂生物学过程的关键途径，也是推动新药研发进程的重要引擎。

服务内容：

疾病、药物处理和环境刺激等条件引起的全蛋白质组差异蛋白定量分析

亚细胞结构（细胞膜、细胞核、线粒体等）全蛋白质组定量分析

全蛋白质组水平生物标志物的发现

技术平台：

科络思生物提供标准化的样品处理方案、蛋白质组定性定量鉴定和专业的数据分析策略。

案例展示：

项目需求：为了对比药物处理组与对照组细胞样品在全蛋白质组水平上的变化，以揭示与药物表型相关的分子机制。我们对每组三次生物学重复的样本运用基于TMT技术的定量蛋白质组学方法，实现对差异表达蛋白的精确鉴定和定量分析。

数据展示：

1. 如蛋白丰度差异火山图显示，六组样品中共同定量蛋白质5987个，对每个蛋白质的比值进行显著性检验分析，药物处理组蛋白质丰度上调为560个，下调为363个，相关强度信息也以热图形式展示。

2. 对差异蛋白质进行Gene_ontology 分析，包括GOTERM_ Biological process；GOTERM_ Cellular component；GOTERM_ Molecular function，KEGG_pathway，通过评判GO term富集程度的显著性水平找到差异蛋白显著富集的功能分类和通路，从而有助于药物分子机制的判断。

3. 以上图为例，上调蛋白质显著富集在nuclear chromosome segregation，mitotic sister chromatid segregation，sister chromatid segregation等信号通路中，表明该药物在分子水平上影响了核内染色质分离过程。